Gedung perkuliahan setiap Fakultas dan Program Studi memiliki tempat tersendiri yang terpadu pada satu lokasi tertentu yang luas.
Kampus Pusat atau biasa disebut Kampus 1 berada di Jalan Wates Km. 10 Yogyakarta
Kampus 2 beralamat di Jalan Jembatan Merah 84 C Gejayan Sleman
Kampus 3 berada di Ringroad Utara Condongcatur Depok Sleman.
Semua area di kampus memiliki fasilitas WiFi hotspot.
Gedung Rektorat Kampus 1:
Gedung ini merupakan Gedung Pusat Universitas Mercu Buana Yogyakarta sebagai Gedung Rektorat. Dalam Gedung Rektorat terdapat banyak ruangan, seperti
Lantai 1 : Ruang Biro Pemasaran (Pendaftaran Mahasiswa Baru), Ruang Seminar, Ruang Yayasan Wangsamanggala, Ruang Keuangan, Bank BPD, Lab. Pusat Bahasa
Lantai 2 : Ruang Rektor, Ruang Wakil Rektor, Ruang Biro Sumber Daya (Rumah Tangga dan SDM), Ruang Sekretaris Rektor, Ruang Biro Akademik (Pelayanan Akademik dan E-learning), Ruang Biro Kemahasiswaan dan Alumni, Ruang Sidang Rektorat, Ruang Pusat Penjaminan Mutu, Ruang Biro Akreditasi, Ruang Humas, Ruang Pusat Penelitian, Pengabdian kepada Masyarakat dan Kerjasama, Ruang Lembaga Sertifikasi Profesi
Lantai 3 : Ruang ICT, Ruang Pelaporan Data Akademik, Lab. Komputer, Aula Rektorat
Gedung Fakultas Agroindustri Kampus 1 :
Gedung ini digunakan untuk Program Studi Agroteknologi, Peternakan dan Teknologi Hasil Pertanian. Dalam gedung ini terdiri dari :
Basement : Laboratorium Program Studi Peternakan dan Agroteknologi
Lantai 1 : Ruang Tata Usaha, Ruang Dekan dan Wakil Dekan, Ruang Rapat, Ruang Seminar, Ruang HMPS, Ruang Perkuliahan
Lantai 2 : Ruang Dosen Program Studi Teknologi Hasil Pertanian, Ruang Dosen Program Studi Peternakan, Ruang Dosen Program Studi Agroteknologi
Lantai 3 : Ruang Perkuliahan
Gedung Fakultas Ekonomi Kampus 1 :
Gedung ini digunakan untuk Program Studi Akuntansi dan Manajemen yang berkuliah di Kampus 1. Dalam gedung ini terdiri dari :
Lantai 1: Ruang Tata Usaha, Ruang Dosen Program Studi Akuntansi, Ruang Dosen Program Studi Manajemen, Ruang Sidang Fakultas Ekonomi
Lantai 2 : Ruang Perkuliahan
Lantai 3 : Ruang Perkuliahan
Gedung Fakultas Psikologi Kampus 1 :
Gedung ini digunakan untuk Program Studi Psikologi yang berkuliah di Kampus 1. Dalam gedung ini terdiri dari :
Lantai 1 : Laboratorium Fakultas Agroindustri, Laboratorium Program Studi Teknologi Hasil Pertanian, Laboratorium Program Studi Agroteknologi, Lobby
Lantai 2: Ruang Tata Usaha Fakultas Psikologi, Ruang Dekan, Ruang Wakil Dekan, Ruang Dosen, Pojok Mahasiswa, Biro Layanan Psikologi,
Lantai 3 : Laboratorium Psikologi, Ruang Perkuliahan
Gedung Perpustakaan :
Gedung Perpustakaan Pusat Univeritas terletak bersebelahan dengan Gedung Ekonomi menghadapt ke Utara. Memiliki koleksi buku yang lengkap dan dilengkapi dengan komputer untuk mengakses jurnal dan internet secara bebas.
Masjid Kampus Hikmah Tawakal
Berdiri tepat di depan kampus 1 Universitas Mercu Buana Yogyakarta. Masjid ini juga sebagai pusat kegiatan Islam di Kampus UMBY.
Gedung Unit Kegiatan Mahasiswa (UKM):
Merupakan gedung untuk Sekretariat kegiatan Mahasiswa dan Lembaga Kemahasiswaan di lingkup UMBY. Gedung ini terletak di sebelah utara Gedung Fakultas Psikologi.
Fasilitas lain :
Gedung di Kampus 2 Gejayan :
Gedung ini digunakan untuk perkuliahan dari Fakutlas Teknologi Informasi, meliputi Program Studi Sistem Informasi dan Informatika.
Disamping itu juga digunakan untuk perkuliahan Fakultas Agroindustri, meliputi Program Studi Magister Ilmu Pangan, Program Studi Peternakan, Program Studi Agroteknologi, Program Studi Teknologi Hasil Pertanian.
Selain itu juga untuk perkuliahan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, meliputi Program Studi Ilmu Keolahragaan, Program Studi Bimbingan dan Konseling, Program Studi Pendidikan Bahasa Inggris, Program Studi Pendidikan Matematika.
Di Kampus 2 ini terdapat Biro Operasional Kampus Cabang yang membantu operasional perkuliahan.
Gedung di Kampus 3 Condong Catur :
Di Kampus 3 ini terdapat Biro Operasional Kampus Cabang yang membantu operasional perkuliahan.
Gedung ini digunakan untuk perkuliahan dari Fakutlas Ilmu Komunikasi dan Multimedia, meliputi Program Studi Ilmu Komunikasi.
Disamping itu juga digunakan untuk perkuliahan Fakultas Psikologi, meliputi Program Studi Magister Psikologi Profesi, Program Studi Magister Psikologi Sains, Program Studi Psikologi.
Selain itu juga untuk perkuliahan Fakultas Ekonomi, meliputi Program Studi Akuntansi dan Program Studi Manajemen.
Di lingkungkan Kampus 3 juga terdapat beberapa fasilitas seperti, Perpustakaan, Masjid, Lapangan Olahraga, Ruang Auditorium, Ruang Ampiteater, Ruang Lembaga Kemahasiswaan, Ruang Bank BRI.